您好，根据您描述的情况，需要结合商品进口及销售模式、店铺主体变更规则等进一步确认。
1. 首先，如果相关鞋类商品已经通过一般贸易方式依法进口至中国境内，并由拟设立的境内子公司作为实际经营主体向境内消费者销售，则原则上可以按照境内电商模式经营。该境内公司应依法办理市场主体登记，并根据实际经营活动承担商品进口（如适用）、税务、消费者权益保护、产品质量、售后等相应责任。日本籍人士担任境内公司的法定代表人，本身通常不影响上述经营模式的可行性。
2. 其次，需要重点核实淘宝平台关于自然人店铺升级为企业店铺以及经营主体变更的现行规则。特别是应确认现有自然人店铺能否直接升级并变更至新设公司名下，以及原店铺历史交易、消费者权益、保证金、税务和其他责任如何衔接。如果平台规则不允许直接变更，则可能需要由新设公司重新开设企业店铺。
3. 另外，如果日本企业拟采用跨境电商零售进口模式，即商品并非先通过一般贸易进口并在境内完成完税后销售，而是通过跨境电商渠道直接面向中国消费者销售，则应按照跨境电商零售进口的相应监管模式操作，并可根据具体业务安排考虑天猫国际跨境电商平台。两种模式在进口主体、海关监管、税收及平台规则等方面存在差异。
因此，不能仅因店铺目前由日本籍个人经营，就认定必须转至天猫国际等跨境平台。建议首先确认商品目前及未来的进口方式、货权安排和实际销售主体，再据此确定采用境内公司经营淘宝店铺还是跨境电商模式；同时，在实施店铺升级前向淘宝平台确认自然人店铺变更为新设企业主体的具体条件和操作要求。
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